ToMMoスパコンニュースNo.3(2018.1.16発行)

スーパーコンピュータシステムの更改について

 2018年4月より、スーパーコンピュータシステムが更改となります。
システム更改に伴い、下記についてご理解とご協力をお願いいたします。

  1. 次期システム導入のための全システムの利用停止
      

    システム停止期間
             2018/1/26(金) 9:00 〜 2018/1/29(月) 9:00
  2. UGEで利用可能なノード数の削減
  3. 接続機器保守のためUnit3、Unit4のシステム利用停止
  4.   

    Unit3,Unit4システム停止期間
            2018/2/5(月) 〜 2018/2/9(金)の間の1日実施予定
             2018/2/9(金) 9:00 〜 17:00
         ※詳細は別途お知らせいたします。
  5. 日次バックアップの停止 [予定:2018/2/5(月) 〜 2018/2/25(日)]
  6. Unit3のGPFSの書込み停止(read only) [予定:2018/2/5(月) 〜 2018/2/18(日)]
  7. Unit3のGPFSの利用停止 [予定:2018/2/18(日) 〜 2018/2/25(日)]
  8. 現システムから次期システムへのデータ移行 [予定:2018/2/9(金) 〜 2018/3/23(金)]
  9. グループアカウントによる運用

3〜7の詳細については、メールや説明会等にてお知らせいたします。ご不明な点は、説明会等またはメールにてお問い合わせください。


メンテナンス情報のお知らせと確認方法について

 これまで、全てのメンテナンス情報をメールでお知らせしておりましたが、重大なものと軽微なものが乱立し、重大なお知らせが見落とされる傾向があることから、下記のような運用を行うこととなりました。ご理解、ご協力をお願いいたします。

これまで
  1. 全てのメンテナンスについて、メールでお知らせ
  2. 全てのメンテナンスについて、本ポータルサイトの「ホーム」のメンテナンススケジュールに掲載
2018年より
  1. 利用者への影響が軽微なメンテナンスについてはメールでお知らせいたしません。
    (例) Lusterへのアクセスが遅延する可能性のあるメンテナンス等
  2. 利用者への影響が重大なメンテナンス、障害について、メールでお知らせいたしまます。
    (例) システム停止を伴うメンテナンス等
  3. 全てのメンテナンス情報について、本ポータルサイトの「ホーム」のメンテナンススケジュールに掲載
注意

各Unitのポータルサイトには、メンテナンス情報の掲載はいたしません。
メンテナンスの有無については、ご利用前に、本ポータルサイトの「ホーム」のメンテナンススケジュールをご確認ください。


解析ツールの更新について

 下記のインストール済みの解析ツールについて最新バージョンに更新しました。

ant-1.10.1
biojava-4.2.9
biopython-1.70
BioPerl-1.7.1
cutadapt-1.15
Cython-0.27.3
Eigen-3.3.4
firefox-45.9.0esr
GenomeAnalysisTK-3.8-0
gnuplot-5.2.2
hdf5-1.10.1
IGV-2.4.4
MAFFT-7.313
meme-4.12.0
openmpi-3.0.0_gcc
ruby-2.4.2
snpEff-4.3t
svn-1.9.7
trinityrnaseq-2.5.1
VCFtools-0.1.15
virtualenvwrapper-4.8.2
zlib-1.2.11
plink-1.90b5.1

■確認方法

各Unitのポータルサイトの[ソフトウェア構成]の検索窓に確認したい解析ツールを入力します。解析ツールのインストール、更新をご希望の場合は、お問い合わせください。


年度更新手続きについて

 スーパーコンピュータシステムの利用期限は、年度末の2018年3月31日となります。
次年度も利用される場合は、更新申請が必要となります。年度更新手続きについては、別途ご連絡いたします。
 次年度のご利用予定がない方については、アカウント利用休止・停止申請書のご提出をお願いいたします。


第2回ユーザ会開催のご案内

 利用者間の交流および、情報共有の場を目的とし、2017年11月より年4回、ユーザ会を開催しております。
今回は、下記の内容について情報共有を予定しております。

■日時
 2018年2月28日

■内容

     

No. 内容
1 スーパーコンピュータ運営委員会でのトピック抜粋
2 次期システム関連伝達事項
3 質疑

※内容は変更になる可能性があります。

ユーザ会開催月(予定)
2月/5月/8月/11月

詳細は、別途ご連絡いたします。


ディスククオータ設定の変更について

 Unit1p、Unit1a、Unit1bの区画について、クオータ値を変更いたしました。

データ削減、グループアカウントでの運用にご協力いただき、ありがとうございます。
まだご対応中の方についても、引き続き、ご対応をお願いいたします。