ToMMoスパコンニュースNo.2(2017.12.11発行)

2017年スパコン利用講習会について

2017年スパコン利用講習会は、終了いたしました。多くの方にご参加いただき、ありがとうございました。
講習会の資料に一部修正がありました。詳細と再取得は下記にてお願いいたします。なお、画像についても、近日公開予定です。

2017年講習会資料


稼働情報の確認方法

 各Unitのポータルサイトにて、稼働状況を確認できるようになりました。ご利用時、ご確認ください。

■確認できる稼働状況

  1. システムの稼働状況
  2. ゲートウェイサーバの使用リソース状況
  3. 共有メモリサーバの使用リソース状況

■確認方法
各Unitのポータルサイトの[稼働状況]


解析ツールの更新について

下記のインストール済みの解析ツールについて最新バージョンに更新しました。

abyss-2.0.2
annovar-2017Jul17
bedtools-2.26.0
blast-2.7.1+
bowtie-1.2.1.1
bowtie2-2.3.3.1
bwa-0.7.17
gcc-5.5.0
gcc-6.4.0
gcc-7.2.0
libxml2-2.9.7
MySQL-5.7.20
numpy-1.13.3
parallel-20171022
picard-tools-2.14.1
pypy-5.9
python-3.6.3
R-3.4.2

 

インストール済みの解析ツール、バージョン、パスは各Unitのポータルサイトにて確認可能です。

■確認方法
各Unitのポータルサイトの[ソフトウェア構成]の検索窓に確認したい解析ツールを入力します。解析ツールのインストール、更新をご希望の場合は、お問い合わせください。


非圧縮の参照配列について

 非圧縮の参照配列を下記に配置しましたのでご利用ください。※各Unitで保存先が異なります。

Unit 配置先
Unit1p /share1/db_uncompressed
Unit1a /share2/db_uncompressed
Unit1b /share2/db_uncompressed
Unit3 /share1/db_uncompressed
Unit4 /share1/db_uncompressed

グループアカウントの利用について

グループアカウントとは、複数人で共有するアカウント(ユーザ)です。ToMMoスーパーコンピュータでは、今後、プロジェクト(分譲、AMEDサービス利用、共同研究等の利用目的)毎にグループアカウントを作成いただき、グループアカウントにログインしてご利用いただくことになりました。
詳細は、こちらをご確認ください。

本ポータルサイトの「情報管理担当者用」からも確認可能です。


年末年始の運用について

 ゲノムプラットフォーム連携センターは、年末年始にかけて下記のとおり休業とさせていただきます。
期間中は、お問い合わせに応じることができず、ご不便をおかけていたしますが、ご了承のほど、よろしくお願いいたします。

<年末年始休業>
2017/12/29 (金) 〜 2018/1/3 (水)

本年は、ToMMoスーパーコンピュータをご利用いただき、ありがとうございました。
来る年もお引き立てのほど、よろしくお願いいたします。


ご不明な点はお気軽にお問い合わせください。