ToMMoスパコンニュースNo.1(2017.11.9発行)

2017年11月ユーザ会開催のご案内

 利用者間の交流および、情報共有の場を目的とし、2017年11月より年4回、ユーザ会を開催いたします。
今回は、下記の内容について情報共有を予定しております。

■日時
 2017年11月

■内容

No. 内容
1 スーパーコンピュータ運営委員会でのトピック抜粋
2 システム関連伝達事項
3 ゲノムプラットフォーム連携センターからのご連絡
4 質疑
5 ディスク使用状況とクオータの変更について

※内容は変更になる可能性があります。

ユーザ会開催月(予定)
2月/5月/8月/11月

詳細は、別途ご連絡いたします。


2017年度スーパーコンピュータ利用講習会のご案内

 今年度も、利用者の皆様にToMMoスーパーコンピュータシステムへの理解を深めていただくことを目的に、講習会を開催いたします。
今回は、新たにLixuxの基礎をハンズオンにて学べるよう企画しております。(事前準備が必要なため、必ず申込をお願いいたします。)
是非ご参加ください。

■詳細

https://sc.megabank.tohoku.ac.jp/2017_lec


NXサーバにおけるメモリ使用量の制限について

 少数ユーザの大量メモリ消費によるサーバ全体への影響回避のため、各UnitのNXサーバに対し、リソース制限としてメモリの使用量の制限(物理メモリ : 16GB)を導入しております。
 NXサーバでの大量のメモリを使う処理を実行して、1ユーザ当たりのメモリ使用量の上限(16GB)に達した時点で、処理が強制終了となります。
大量のメモリを使う処理を実行する場合、以下のいずれかかを実施するよう、お願いいたします。

  1. qlogin用ノード上での実行
  2. 共有メモリ型計算機での実行

    Unit1p tma101
    Unit1a cla208(256GBメモリ)
    Unit1b clb208(256GBメモリ)
    Unit3 tmc101
    Unit4 tmd101、tmd201
  3. UGEによるジョブの投入

便利なコマンド(ldapid)について

 スーパーコンピュータ上でご自身が所属するグループおよび、グループアカウントについて、下記のことが確認できるコマンドがあります。
データ共有時や申請時に実行してご確認ください。

  • 所属しているグループのメンバーの確認
  • グループアカウントに紐付けされているアカウントの確認

詳細は、各Unitのポータルサイトの「利用方法」ー>ソフトウェア利用方法ー>スーパーコンピュータ用独自コマンド「ユーザ情報の確認(ldapidコマンド)」をご確認ください。

<実行例>

$ ldapid
======================================
unitX User LDAP confirmation tool
======================================
[No] UserName:(UserID):PrimaryGrp,SubGrp...
======================================
[ 1] taro(uid=0000) [taro.seiryo]: lab1,lab2
[No] UserID: PublicKey condition
======================================
[Belong with]     proj1 [Shared User]
[Belong with]     proj2 [Shared User]
======================================
[No] GroupName:(GroupID):Member...
======================================
[SELECT] proj1(gid=1111):
[ 1] proj1: proj1
[ 2] aoba: aoba.miyagi
[ 3] hagi: hagi.tsukino

便利なコマンド(showquota)について

 自分自身および、所属するグループのディスク使用量やクオータの設定値を確認できるコマンドがあります。
個人のアカウントとグループアカウントには、ディスク使用量を制限しております。制限値を超えた状態で7日間経過すると、ファイルの書込みができなくなりますので、定期的にコマンドで現状をご確認ください。
なお、Unit1p以外の区画について、制限値の90%を超えた場合は、シンクライアントメールで通知することを開始しました。

<実行例>

$ showquota
=============== User Quota Information  ===============

[BLOCK quota of seiryo account]
filesystem :         used/   softlimit/   hardlimit
/share1    :       0.06TB/     20.00TB/     25.00TB
/share3    :       0.00TB/     20.00TB/     25.00TB

[I-NODE quota of hirano account]
filesystem :         used/   softlimit/   hardlimit
/share1    :        31837/   100000000/   125000000
/share3    :            0/   100000000/   125000000

=============== Group Quota Information ===============

[BLOCK quota of lab1 group]
filesystem :         used/   softlimit/   hardlimit
/share1    :      41.12TB/     nolimit/     nolimit
/share3    :       0.00TB/     nolimit/     nolimit

[I-NODE quota of kinolab group]
filesystem :         used/   softlimit/   hardlimit
/share1    :     50477226/     nolimit/     nolimit
/share3    :            0/     nolimit/     nolimit

ご不明な点はお気軽にお問い合わせください。