ソフトウェア

Phase2:ゲノム医科学用供用スーパーコンピュータ

  1. オペレーティングシステム
    • ログインノード:RedHat Enterprise Linux 7
    • 計算ノード:CentOS 7
  2. ジョブ管理システム
    • Univa Grid Engine 8.5
  3. コンパイラー
    • GCC
    • Intel Parallel Studio XE 2018 Composer Edition for Fortran & C++ Linux
      • インテル C++ コンパイラー
      • インテル Fortran コンパイラー
      • インテル Distribution for Python
      • インテル MKL – 高速な数学ライブラリー
      • インテル IPP – 画像、信号、およびデータ処理
      • インテル TBB – C++ スレッド・ライブラリー
      • インテル DAAL – マシンラーニングとデータ解析
  4. 各種次世代シークエンサー解析用オープンソースソフトウェア
    • Mapping Tool
    • Adapter remove
    • Data Processing Tool
    • Structural Variation
    • Variant Call Annotation
    • etc..その他についてはお問い合わせください

Phase1:大規模ゲノムコホート解析システム

  1. オペレーティングシステム
    • RedHat Enterprise Linux
  2. ジョブ管理システム
    • Univa Grid Engine
  3. コンパイラー
    • Intel Cluster Studio for Linux
      • Intel C++ Composer XE Linux版
      • Intel Fortran Composer XE Linux版
      • Intel MKL Linux版
      • Intel IPP Linux版
      • Intel TBB Linux版
      • Intel MPI ライブラリー Linux版