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本資料はPhase 3スパコンに関する作成中の資料であり、未記載のページが含まれております。現在、随時更新中です。
ToMMoスーパーコンピュータ ドキュメント
ToMMoスーパーコンピュータ ドキュメント

目次

  • 初めてToMMoのスパコンを利用する方へ
  • 利用方法
    • 利用開始方法の概要
    • Duo Mobileを利用するために必要なもの
    • Duo Mobileアプリのセットアップ
    • パスワードの変更・プロジェクト有効化方法
    • 接続方法
    • Unit B/Cへのデータの持ち込み方法
    • Unit Aとインターネットにつながった手元の端末でデータを転送する方法
    • Unit B/Cからのデータの持ち出し方法
    • Linux 初学者向けガイド
      • 1. ターミナル操作の基本
      • 2. ファイルの操作
      • 3. ファイルの読み書きとコマンドの繋ぎ方
      • 4. テキスト処理
      • 5. ファイルのダウンロードと圧縮・展開
      • 6. アクセス権の管理
      • 7. 一歩進んだシェルの使い方
      • 8. テキストエディタ
      • 9. シェルスクリプト入門
      • 10. Singularityの使い方
    • 各種ソフトウェアの利用方法
    • 自分でソフトウェアをインストールする方法
      • Rのモジュールをインストールする方法
      • Pythonのモジュールをインストールする方法
    • ジョブスケジューラー
      • Slurmの概要
      • リソースの確認
      • 基本的な利用方法
      • アレイジョブ
      • 依存関係ジョブ
      • GPUジョブ、Singularityジョブ
      • 使用リソースの検討
  • システムについて
    • Unitの区別
    • アカウントの種類
    • Duo Security
    • スパコンのディレクトリ構成
    • ハードウェア
  • Phase 2スパコンからの変更点
    • アカウント体系の変更
    • 利用方法の変更点
    • データ移行について
  • スパコンのサービス
    • 提供サービス
    • データベース
    • ソフトウェア
      • 開発用ソフトウェア
        • cget
        • cmake
        • deno
        • dotnet
        • erlang
        • gauche
        • gawk
        • git
        • go
        • julia
        • lua
        • luajit
        • matlab-runtime
        • nim
        • ninja
        • nodejs
        • octave
        • perl
        • pypy2.7
        • pypy3.7
        • pypy3.8
        • pypy3.9
        • python2.7
        • python3.10
        • python3.6
        • python3.7
        • python3.8
        • python3.9
        • R
        • racket
        • rakudo
        • ruby
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      • Shell
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      • Rモジュール
        • R34-recommended
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        • R36-recommended
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        • R41-recommended
        • R42-recommended
      • Pythonモジュール
        • py310-recommended
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      • コンパイラ
        • gcc
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        • llvm
      • ツール
        • apache-fop
        • apache-pdfbox
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        • csv2xlsx
        • datamash
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      • その他
        • 3D-slicer
        • EIG
        • FreeSurfer
        • HDFView
        • MRIConvert
        • Minimac4
        • PRS-cs
        • PRSice
        • PyMOL
        • SAIGE
        • SIDESPLITTER
        • SPM
        • VisiData
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        • bgenix
        • ctffind
        • ensembl-vep
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        • metal
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        • qctool
        • regenie
        • relion
        • valgrind
      • デスクトップ環境のみのソフトウェア
  • データセキュリティ
    • スパコンを利用するにあたって守っていただきたいこと
    • 情報管理責任者などの役割
    • データ持ち出しについて
    • データ持ち込みについて
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